welche von den beiden pumpen meinst du? die am kühler oben befestigt ist oder die unter dem kühlwasser behälter?
die pumpen sind beide die gleichen und können untereinander getauscht werden, haben aber elektrisch aber nichts miteinander zu tun.
die obere am kühler wird über die thermoschalter der kühlerlüfter angeschalten.
die untere ist dafür zuständig, um das warmwasser bei langsam drehendem motor (z.b. im stau oder an der ampel) weiterhin in den heizwasserkreislauf zu pumpen. wenn die pumpe nicht läuft dann wird kalt... 
angesteuert wird sie über die klimaautomatik, bei meinem 96er MV6 mit dem zündungsplus, bei späteren modellen macht das die klimaautomatik nur bei bedarf.
wenn die pumpe gar nicht läuft sind in der regel die motorkohlen runter. entweder ne neue pumpe kaufen (teuer) oder die motorkohlen wechseln... ich habe das auch schon getan, ist nicht schwer. bei bedarf gebe ich dir eine internetadresse per PN wo du die motorkohlen mit anleitung zum wechseln herbekommst.
Also die kleine Wasserpumpe die direkt am Kuehler befestigt ist wird ueber den Stromkreis des Kuehlerluefters angesteuert. Wenn die erste Stufe startet dann sollte die Pumpe auch laufen. zum testen einfach mal den Stecker abziehen und Motor an und warten bis der E-Luefter anspringt. dann mit nem einfachen Messgeraet oder Prueflampe messen ob an dem Stecker auch 12V anliegen. Wenn nicht ist entweder einer der beiden Thermoschalter defekt oder du hast nen Kabelbruch oder ne schlechte Masseverbindung.
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